Il palazzo ha mantenuto inalterato l’assetto originario, con il doppio loggiato interamente aperto e con collocazione delle due scale principali in corrispondenza ai suoi due angoli opposti, a preservare l’unitarietà dello spazio centrale, secondo il modello dell’impostazione di molti palazzi rinascimentali romani e fiorentini.

Nell’ angolo nord-est si apre lo scalone d’onore, che conduce al loggiato del piano nobile; mentre, sul lato opposto, nell’angolo sud-ovest del cortile, si trova una elegante scala elicoidale, strutturata su una balaustra in muratura continua, sulla quale si impostano, in tre giri di spirale, diciannove colonne tuscaniche.

Non meno suggestive sono le Sale Ipogee al piano interrato: uno spazio di pregio e dedicato all’allestimento di mostre ma anche a suggestivi eventi, anch’esse interamente recuperate. Sono raggiungibili dal cortile d’onore tramite due ingressi, posti in posizione simmetrica.
Il restauro ha disegnato un nuovo accesso diretto da strada Farini, tramite l’antico piccolo portale d’ingresso, che condurrà agli spazi espositivi, attraversando un locale dove si possono ammirare le vestigia delle mura tardo-antiche dalla città, i resti di una necropoli longobarda e la sezione basamentale delle mura romane, sovrapposte le une alle altre, rinvenute nel corso dei lavori.

Le Sale Ipogee presentano volte a botte unghiate in laterizio e intonacate, si possono osservare anche undici campate, una tripla serie di volte a crociera su pilastri quadrati, con incassi per le torce, che conservano tracce dell’antica decorazione ad affresco.
Il piano interrato è dotato inoltre di un’ampia ghiacciaia circolare (altezza m.2,6, diametro 6,3 m.) con copertura a cupola.

Al piano terra l’ampio Salone delle Allegorie, con volta lunettata interamente dipinta ad affresco: nelle lunette figure mitologiche si alternano a giare monocromatiche, nelle vele figure a grottesca, mentre il soffitto è ornato da motivo a trompe-l’oeil, costituito da un pergolato con tralci di fiori e frutta, attraverso cui è visibile l’azzurro del cielo, delimitato da una balaustra, secondo un progetto iconografico che potrà essere definito solo a restauro ultimato.